AMPLIFIKASI GEN 16S-rRNA BAKTERI TERMOFILIK DARI SUMBER AIR PANAS, GUNUNG PANCAR BOGOR

Suryani -, Laksmi Ambarsari, Efi Sanfitri Harahap

Abstract


 

ABSTRACT

 

Exploration of thermophilic bacteria that produce thermostable enzyme is most useful in application for enzyme base industrial. The aim of of this research is to isolate and amplificate the 16S-rRNA gene from thermophilic bacteria isolate at hotspring, Mount of Pancar, Bogor. The research steps consist of bacteria isolation, chromosomal DNA extraction, and amplification of 16S-rRNA gene. The water sample as source for bacteria was collected from four cauldrons. Temperature and pH for each cauldron are red cauldron 75-80°C, pH 7; black cauldron 55°C, pH 7; white cauldron 57°C, pH 7; and saline cauldron 25°C, pH 6, respectively. The bacteria were cultivated at Luria Bertani (LB) and Thermus media. The chromosomal DNA have been extracted. Gene amplification of 16 S-rRNA have been carried out by using universal primer (Bac F1 and Uni B1). The size of amplicon is ± 1.5kb.

 

Keywords : thermophilic bacteria, chromosomal DNA extraction, amplification of 16S-rRNA gene


Full Text:

PDF

References


M. T. Madigan, B. L. Marrs, Extremophiles, Sci. Am., 82-87, (1997).

T. D. Brock, An overview of The Thermophiles. dalam Brock T D. Thermophiles: General, Molecular and Applied Microbiology, Jhon Wiley & Sons, New York, 1986.

R. I. Amann, W. Ludwig, K. H. Schleifer, Identification of uncultured bacteria: a challenging task for molecular taxonomist, ASM News, 60: 360-365, (1994).

T. Desiliyarni, Analisis keragaman genetik bakteri termofilik dari Kawah Candradimuka, Pegunungan Dieng dengan teknik PCR-RFLP Gen 16S-rRNA, [Tesis], Bogor: Program Pasca Sarjana, Institut Pertanian Bogor, 1999.

E. C. Bottger, Approaches for identification of microorganisms, ASM News, 62: 247-250, (1996).

R. G. Taylor, Polymerase Chain Reaction: Basic Principles and Automation, Oxford University Press, Oxford New York, 1992.

Indrajaya et al., Isolasi dan identifikasi mikroorganisme termofil isolat Kawah Wayang, Jurnal Mikrobiologi Indonesia, 8: 53-56, (2003).

M. W. W. Adams and R. M. Kelly, Enzymes from microorganisms in extreme environments, Chemical and Engineering News (reprints), 1995.




DOI: http://dx.doi.org/10.25077/jrk.3.1.83.2009

Refbacks

  • There are currently no refbacks.


@copyright Jurnal Riset Kimia FMIPA Universitas Andalas